El colágeno puede ser degradado por proteasas específicas, es decir, biodegradable. Debido a que el colágeno tiene una estructura helicoidal apretada y firme, la mayoría de las proteasas solo pueden cortar sus cadenas laterales. Solo proteasas específicas como la colagenasa y la elastasa pueden degradar el colágeno y romper los enlaces peptídicos del colágeno en condiciones específicas. Una vez que se rompe el enlace peptídico del colágeno, su estructura helicoidal se destruye y se hidroliza completamente en polipéptidos o aminoácidos de pequeño peso molecular. Las sustancias de pequeño peso molecular pueden ingresar al sistema circulatorio sanguíneo y ser reutilizadas o metabolizadas por el cuerpo. La biodegradabilidad es la base para que el colágeno se utilice como material de trasplante de órganos.
